Kit de PCR con especificación de metilación (MSP)

Kit de detección de PCR específico para metilación.

El kit de PCR específico para metilación (MSP) está especialmente desarrollado para clientes que estudian las características de metilación del ADN genómico mediante PCR, en el que la ADN polimerasa de MSP es una polimerasa termoestable modificada con anticuerpos y el tampón de PCR 10 × MSP es un tampón de PCR optimizado especialmente para Reacción de MSP. Es compatible con el kit de conversión de bisulfito de ADN de TIANGEN (4992447).

Gato. No Tamaño de embalaje
4992759 50 preparaciones

Detalle del producto

Flujo de trabajo

Ejemplos experimentales

Preguntas más frecuentes

Etiquetas de productos

Características

■ El producto tiene las ventajas de rapidez, sencillez, alta sensibilidad, fuerte especificidad y buena estabilidad.

Especificación

Escribe: ADN polimerasa MSP
Plantilla: <500 ng
Aplicaciones: Es adecuado para el método de PCR específica de metilación (MSP) para analizar las características de metilación del ADN genómico.

Todos los productos se pueden personalizar para ODM / OEM. Para detalles,haga clic en Servicio personalizado (ODM / OEM)


  • Anterior:
  • Próximo:

  • product_certificate04 product_certificate01 product_certificate03 product_certificate02
    ×

    1. Se aplicó el kit de PCR específica de metilación (MSP) para amplificar el fragmento de 400 pb utilizando ADN genómico tratado con bisulfito como molde con un sistema de reacción de 20 µl.

    Experimental Exampl

    2. Configuración del ciclo de reacción de PCR

    Experimental Exampl

     

    Experimental Examples 1: Muestras procesadas por el Proveedor A;
    2: Muestras procesadas por el Proveedor B;
    3: Muestra tratada con TIANGEN 4: NTC; M: D2000
    Experimental Examples 1-6:
    6 repeticiones;
    7: Proveedor Una muestra procesada;
    8: NTC; Bio2-F / R y P16-Me-F / R: dos cebadores de detección.
    P: sin bandas de amplificación

    Plantilla A-1

    ■ La plantilla contiene impurezas de proteínas o inhibidores de Taq, etc. —Purifique la plantilla de ADN, elimine las impurezas de proteínas o extraiga el ADN de la plantilla con kits de purificación.

    ■ La desnaturalización de la plantilla no es completa —— Aumente adecuadamente la temperatura de desnaturalización y prolongue el tiempo de desnaturalización.

    ■ Degradación de la plantilla: vuelva a preparar la plantilla.

    Imprimación A-2

    ■ Mala calidad de los cebadores: vuelva a sintetizar el cebador.

    ■ Degradación de la imprimación: alícuota las imprimaciones de alta concentración en un volumen pequeño para su conservación. Evite la congelación y descongelación múltiples o criopreservados a 4 ° C a largo plazo.

    ■ Diseño inadecuado de los cebadores (por ejemplo, la longitud del cebador no es suficiente, se forma un dímero entre los cebadores, etc.) - Rediseñe los cebadores (evite la formación del dímero del cebador y la estructura secundaria)

    A-3 Mg2+concentración

    ■ Mg2+ la concentración es demasiado baja —— Aumente adecuadamente el Mg2+ concentración: Optimice el Mg2+ concentración mediante una serie de reacciones de 1 mM a 3 mM con un intervalo de 0,5 mM para determinar el Mg óptimo2+ concentración para cada plantilla y cebador.

    A-4 Temperatura de recocido

    ■ La alta temperatura de recocido afecta la unión del cebador y la plantilla. ——Reducir la temperatura de recocido y optimizar la condición con un gradiente de 2 ° C.

    A-5 Tiempo de extensión

    ■ Tiempo de extensión corto —— Aumente el tiempo de extensión.

    P: falso positivo

    Fenómenos: las muestras negativas también muestran las bandas de la secuencia objetivo.

    A-1 Contaminación de PCR

    ■ Contaminación cruzada de la secuencia diana o los productos de amplificación —— Tenga cuidado de no pipetear la muestra que contiene la secuencia diana en la muestra negativa ni derramarla fuera del tubo de centrífuga. Los reactivos o el equipo deben esterilizarse en autoclave para eliminar los ácidos nucleicos existentes, y la existencia de contaminación debe determinarse mediante experimentos de control negativo.

    ■ Contaminación de los reactivos ——Aliquiar los reactivos y almacenar a baja temperatura.

    A-2 Primer

    ■ Mg2+ la concentración es demasiado baja —— Aumente adecuadamente el Mg2+ concentración: Optimice el Mg2+ concentración mediante una serie de reacciones de 1 mM a 3 mM con un intervalo de 0,5 mM para determinar el Mg óptimo2+ concentración para cada plantilla y cebador.

    ■ Diseño de cebador inadecuado y la secuencia objetivo tiene homología con la secuencia no objetivo. —— Rediseño de imprimaciones.

    P: amplificación no específica

    Fenómenos: Las bandas de amplificación por PCR no son coherentes con el tamaño esperado, ya sea grande o pequeño, o en ocasiones se producen tanto bandas de amplificación específicas como bandas de amplificación no específicas.

    Imprimación A-1

    ■ Pobre especificidad del cebador

    —— Imprimación de rediseño.

    ■ La concentración de imprimación es demasiado alta —— Aumente adecuadamente la temperatura de desnaturalización y prolongue el tiempo de desnaturalización.

    A-2 Mg2+ concentración

    ■ El Mg2+ la concentración es demasiado alta —— Reduzca adecuadamente la concentración de Mg2 +: Optimice la concentración de Mg2+ concentración mediante una serie de reacciones de 1 mM a 3 mM con un intervalo de 0,5 mM para determinar el Mg óptimo2+ concentración para cada plantilla y cebador.

    Polimerasa termoestable A-3

    ■ Cantidad excesiva de enzimas: reduzca la cantidad de enzimas de manera adecuada a intervalos de 0,5 U.

    A-4 Temperatura de recocido

    ■ La temperatura de recocido es demasiado baja —— Aumente adecuadamente la temperatura de recocido o adopte el método de recocido de dos etapas

    Ciclos de PCR A-5

    ■ Demasiados ciclos de PCR: reduzca el número de ciclos de PCR.

    P: bandas parcheadas o manchadas

    Imprimación A-1—— Escasa especificidad —— Rediseñe el cebador, cambie la posición y la longitud del cebador para mejorar su especificidad; o realizar una PCR anidada.

    Plantilla de ADN A-2

    ——La plantilla no es pura ——Purifique la plantilla o extraiga el ADN con kits de purificación.

    A-3 Mg2+ concentración

    ——Mg2+ la concentración es demasiado alta —— Reduzca adecuadamente el Mg2+ concentración: Optimice el Mg2+ concentración mediante una serie de reacciones de 1 mM a 3 mM con un intervalo de 0,5 mM para determinar el Mg óptimo2+ concentración para cada plantilla y cebador.

    A-4 dNTP

    ——La concentración de dNTP es demasiado alta —— Reducir la concentración de dNTP de forma adecuada

    A-5 Temperatura de recocido

    ——Temperatura de recocido demasiado baja —— Aumente adecuadamente la temperatura de recocido

    Ciclos A-6

    ——Demasiados ciclos ——Optimizar el número de ciclo

    P: ¿Cuánto ADN molde se debe agregar en un sistema de reacción de PCR de 50 μl?
    ytry
    P: ¿Cómo amplificar fragmentos largos?

    El primer paso es elegir la polimerasa adecuada. La polimerasa Taq regular no se puede corregir debido a la falta de actividad exonucleasa 3'-5 ', y el desajuste reducirá en gran medida la eficacia de extensión de los fragmentos. Por lo tanto, la polimerasa Taq regular no puede amplificar eficazmente fragmentos diana mayores de 5 kb. Se debe seleccionar la polimerasa Taq con modificación especial u otra polimerasa de alta fidelidad para mejorar la eficiencia de extensión y satisfacer las necesidades de amplificación de fragmentos largos. Además, la amplificación de fragmentos largos también requiere el ajuste correspondiente del diseño del cebador, el tiempo de desnaturalización, el tiempo de extensión, el pH del tampón, etc. Normalmente, los cebadores con 18-24 pb pueden conducir a un mejor rendimiento. Para evitar daños en la plantilla, el tiempo de desnaturalización a 94 ° C debe reducirse a 30 segundos o menos por ciclo, y el tiempo para aumentar la temperatura a 94 ° C antes de la amplificación debe ser inferior a 1 min. Además, establecer la temperatura de extensión en aproximadamente 68 ° C y diseñar el tiempo de extensión de acuerdo con la velocidad de 1 kb / min puede garantizar una amplificación eficaz de fragmentos largos.

    P: ¿Cómo mejorar la fidelidad de amplificación de la PCR?

    La tasa de error de la amplificación por PCR se puede reducir utilizando varias ADN polimerasas con alta fidelidad. Entre todas las ADN polimerasas Taq encontradas hasta ahora, la enzima Pfu tiene la tasa de error más baja y la mayor fidelidad (ver tabla adjunta). Además de la selección de enzimas, los investigadores pueden reducir aún más la tasa de mutación de la PCR optimizando las condiciones de reacción, incluida la optimización de la composición del tampón, la concentración de polimerasa termoestable y la optimización del número de ciclos de PCR.

    Escriba aquí su mensaje y envíenoslo